遵照教育部“高等学校仪器设备管理办法”和“高等学校实验室管理规程”的规定以及“山西省高等学校实验系列专业技术职务评审条件”、“山西农业大学实验室工作条例”、“ 山西农业大学实验设备管理的规定”、“ 山西农业大学教学实验经费管理暂行办法”等相关文件，“中心”制定了完善的规章制度，实施标准化、规范化的管理。

“中心”实验动物的管理参照“医学实验动物管理实施细则（1998年1月25日卫生部令第55号发布）”、“实验动物管理条例（中华人民共和国国家科学技术委员会，1988年11月14日，国家科学技术委员会第2号令）”、“实验动物质量管理办法 (1997年12月11日国科发财字[1997]593号发布)”、“中华人民共和国科技部（科学技术部、卫生部、教育部、农业部、国家质量监督检验检疫总局、国家中医药管理局、中国人民解放军总后勤部卫生部）关于发布《实验动物许可证管理办法(试行)》的通知，国科发财字［2001］545号）”的有关规定。